Предшественником Актюбинского университета им. Жубанова стал педагогический институт, основанный в 1966 году. Тогда вуз принимал абитуриентов всего на 2 факультета, сегодня же он является многопрофильным учебным заведением высшего уровня.
В 1990 году институту присвоили имя Кудайбергена Жубанова, который являлся первым в Казахстане профессором-лингвистом. Спустя 6 лет институт получил новый статус, его стали называть Актюбинским университетом имени Жубанова. А ещё через 5 лет ему придали статус государственного образовательного заведения высшего звена.
Сегодня в Актюбинском университете, входящем в число ведущих вузов на территории Западного Казахстана, имеется развитая учебно-техническая база. Он владеет несколькими учебными корпусами, двумя общежитиями, студенты пользуются лабораторией, агробиостанцией, спорткомплексом, плавательным бассейном. Также есть Дворец студентов, студенческая поликлиника, библиотека. Учебные аудитории оснащены современными компьютерами, которые подключены к интернету.
Кроме того, в университете им. Жубанова функционирует несколько НИИ, научных лабораторий и центров, научно-педагогический центр.