Автовокзал Кокшетау расположен в черте города неподалеку от железнодорожного вокзала. Является важным транспортным узлом, обслуживая несколько копаний-перевозчиков, автобусы которых движутся по междугородним маршрутам. Автовокзал был основан в 1981 году. На сегодняшний день общая численность персонала составляет порядка 50 человек. В здании расположены кассы, зал ожидания, зональный пункт полиции. Уехать с автовокзала Кокшетау можно по нескольким направлениям: Астанинскому, Петропавловскому, Омскому, Атбасарскому, Красноярскому.
Долгое время здание автовокзала вызывало множество нареканий со стороны пассажиров. Посетители отмечали неудовлетворительное состояние самого здания, его помещений и прилегающей территории. Во время подготовки города к международной выставке «ЭКСПО» здесь была проведена реконструкция. Здание привели в соответствие с противопожарными нормами, установили металлодетекторы, уложили специальную тактильную плитку и пандус для людей с ограниченными возможностями, обновили интерьер. Кроме того, был частично обновлен автобусный парк.